En los últimos años, la exploración de la conformación tridimensional (3D) del genoma ha aportado profundos conocimientos sobre la regulación de la expresión génica y las funciones celulares tanto en animales como en plantas. Mientras que los animales presentan una topología genómica característica definida por dominios topológicamente asociados (TAD), las plantas muestran características similares con una conformación más diversa entre especies. Empleando técnicas avanzadas de secuenciación de alto rendimiento y microscopía, investigamos el paisaje de 26 modificaciones de histonas y la distribución de la ARN polimerasa II en tomate (Solanum lycopersicum). El estudio desveló un paisaje epigenético rico y lleno de matices, arrojando luz sobre distintos estados de la cromatina asociados con la formación de heterocromatina y el silenciamiento génico. Además, hemos dilucidado la intrincada interacción entre estos estados de la cromatina y la topología general del genoma. Empleando un enfoque genético, profundizamos en el papel de la modificación de la histona H3K9ac en la topología del genoma. En particular, nuestrala investigación reveló que la deposición ectópica de esta marca de la cromatina desencadenó una reorganización de la estructura tridimensional de la cromatina, definiendo diferentes bordes similares a TAD. Nuestro trabajo enfatiza el papel crítico de H3K9ac en la conformación de la topología del genoma del tomate, proporcionando información valiosa sobre el paisaje epigenético de esta especie de cultivo de importancia agrícola.
